次に考えられる原因はセンサー系。そこで点火時期と失火カウントを確認。3速5000rpm付近で失火カウント入ってますが、実際は失火してません。
初めて知りましたが失火カウントはクランク角センサーの角速度変動で判定してるだけで、実際の失火を検知してる訳ではなかった･･･
結果はよく分からないからイグニッションコイル変えとくか、って感じですね。