エンジンブロック載せ替え

Ｈ16年3月に１年落ちで認定中区車として購入しました。購入時から信号待ちなどの停車時にエンスト、アイドリング異常の症状がたびたび出ていました。その都度イグニッションコイル、ノッキングセンサーの交換を行いましたが、再発を繰り返してきました。この度BMW JAPANの方からクレームで「載せ替え」の許可が出て、「エンジンブロックの載せ替え」となりました。
症状が出続けた原因としては、オイルセパレータ交換時にピストンリングにカーボン等のカスが着いてしまい、カスによってシリンダー内部に傷が付き、ピストンの動きが悪くなったためとのことでした。
載せ替えとなったことについては、保証対象と認められたため、シリンダー内部を個別に磨くより、エンジンを載せ替えた方がコスト的に（ディラーが楽？）安くつくからとのことでした。
エンジンブロックは完全に新品だそうです（画像でもご確認いただけると思います。のぞいて見える機械が新しいです）が、エンジン形式は変わらずN42のままとのこと。japanの方でN４２の部品を持っているからとの説明でした。
エンジンがごっそり変わった訳ですが、慣らし運転等は基本的に必要ないとのことでした。急発進、急停車さえしなければ良いとのこと（少々疑問が残りますが・・・）。
ここまでやれば大丈夫だと思うのですが、同じ症状が出ないことを祈っています。
現在走行距離は２万５千㎞ですが、実質０㎞からのスタートとなるのか私には分かりません。