無い知恵絞って考えました。
ボルト穴の深さを測って下さい。２０㎜弱だったと思います。それと穴の直径。
ギリギリの大きさの平頭ネジ（錆びを考慮してステンレス製を使用しました）を穴の数ほど用意します。（ホームセンター等で売ってます）
金属専用接着剤でネジをルーフレール固定用のボルト穴に入れて接着します。
これで穴は見事潰れました！
ネジが細すぎたり、接着剤を着けすぎると天井内に垂れるので注意して下さい。