カップを切除して、バッフルのテンプレートをあてがっているところです。

カップ部分がそっくりなくなっているのがおわかりになると思います。
あてがわれているバッフルは、製品版を切り出すための「テンプレート」ですので無塗装ですが、製品版のほうは、硬さを増すためにMDF改質剤を含浸させた上で、黒サフェーサーで防護しています。

固定の方法はちょっと複雑です。
(1)バッフルとドアトリムの締結は、ドアトリムの既存の3つのネジ穴を貫通させてから、ドアトリム裏側から木ネジを締め込むことによって行っています。
(2)次に、バッフルと一体化したドアトリムと、インナーパネル（鉄板）の締結ですが、これはバッフルに空けてある4つのネジ穴から、インナーパネル側に新たに設けた穴に向かってボルトを通し、締め込むことで行っています。

上記(1)の加工のみで、純正スピーカーの取り付けと同等の締結力は発揮できているわけですが、スピーカーバスケットを出来るだけ強固に固定するには、(2)の工法をとって、（土木系のアンカーボルトのように）インナーパネルにまでボルトを到達させておきたいところです。

最後になりますが、バッフルに空いている穴をヘコませてある（皿穴といいます）のは、ネジ頭を沈ませることで、スピーカーを取り付ける際に、ネジの頭がスピーカーのフランジ面にあたって、浮かないようにすることを目的としています。