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 Genome phylogenetic tree analyses revealed evidence that the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 had been introduced to Taiwan, the United States, and Japan several times

ゲノム系統樹分析により、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2は、台湾、米国、および日本に複数回導入されたという証拠が明らかとなった

［要旨］

世界的な重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-Cov-2）感染が、経済と人々の不安を混乱させている。

国民たちの不安が政府と医療従事者の心理的負担を増大させ、懸念を持つ人々は、政府に国境措置を求めている。しかし、このウイルスの国境対策は可能だろうか？

今回、48のほぼ完全なウイルスゲノム配列を分析することにより、台湾、米国、および日本に侵入したウイルスが独立して導入されたことがわかった。 13個の節約情報サイトと 3つのグループ（CTC、TCC、およびTCT）を特定した。

その結果、台湾、米国、および日本の都市で見つかったウイルスは、同じ国の他の都市で見つかったウイルスと単系統のクレード（共通の祖先からの単一の起源をもつとされる因子）を形成しなかった。これらの結果は、このウイルスに対する効果的な国境対策の実施の難しさを示唆している。

［結果と考察］

まず、SARS-Cov-2（新型コロナウイルスのこと）のゲノム系統樹を取得した。

それが示すところは、台湾、米国、および日本の都市で見つかったウイルスは、同じ国の他の都市で見つかったウイルスと単系統のクレードを形成しなかった。この結果は、ウイルス侵入がこれら 3か国で独立して発生したことを示唆している。

この研究では、69のバリアントサイト（変異した箇所）が見つかった。 13の節約情報サイトが見つかり、そのうちの 3つが重要だった（下の図）。

13個の節約情報サイトは、614、2662、5084、8782、18060、24034、24325、26144、26729、28077、28144、28854、およびSARS-Cov-2 ゲノム（MN908947）の 29095番目のヌクレオチドにあった。

（この後も詳しい解説数値が続きますが、略します）

将来世界のさまざまな部分で分離されたウイルス配列が局所的に獲得された突然変異であるか、または起源の場所の多様性を反映しているかどうかを判断するには、さまざまな SARS-Cov-2 ゲノム配列を起源の場所で収集する必要がある。